Die diplomatischen Beziehungen werden von der deutschen Botschaft Jaunde (Kamerun) wahrgenommen.

Die bilateralen Handelsbeziehungen sind wenig ausgeprägt. Deutsche Unternehmen exportieren hauptsächlich Maschinen, Boote, Getränke, Fabrikationsanlagen und Kraftfahrzeuge. Importiert werden zuvorderst Erdöl und chemische Erzeugnisse aus Äquatorialguinea.

Deutschland und Äquatorialguinea arbeiten im Bereich des Regenwaldschutzes zusammen.